Xã nằm cách trung tâm thủ đô Hà Nội khoảng 45 km về phía Tây; nằm ở vị trí trung tâm các xã phía Bắc của huyện và cũng là xã có nền kinh tế phát triển nhất khu vực này; phía Bắc Giáp với xã Mỹ Thành, phía Tây giáp với xã Tuy Lai, phía Nam giáp với xã Hồng Sơn và Lê Thanh.
Xã Mỹ Đức có 3 thôn: Tảo Khê, Kinh Đào, Đoan Nữ.